독서잡기201005

   린 마굴리스의 <공생자행성>을 읽고 있다. 사실 분량도 얼마 안되고, 재미도 최강이라 금방 읽긴 할 것 같다. 게으름과 체력이 문제일뿐이다.

린 마굴리스는 연속 세포 공생이론으로 유명하다. 비주류에 속하는 학자이긴 하지만, 그가 주장하는 내용 중 세포 소기관인 엽록체 미트콘드리아가 이전에는 독립된 생활을 하던 세균이었다는 내용은 주류 내에서 전반적으로 받아들여지는 모양이다.

근데 그럼에도 불구하고 린 마굴리스의 이름이 언급된 걸 잘 보지는 못했던 것 같다.  얼마전 <세포 : 생명의 마이크로 코스모스 탐사기>라는 책을 잠깐 훑어 보았는데, 글쎄 린 마굴리스의 언급이 전혀 없는 것 같다.  저자의 말에 따른 세포연구의 연대기를 표방한다는데...  

하여튼, 저자는 책에서 진화가 공생에서 비롯됨을 주장한다.  역자의 말처럼 이것이 어떠한 윤리적 함의를 담고 있는 것은 아니겠지만,  진화에 대한 주류에 위치한 설명보다는 더 와닿기는 한다. 뭐... 그것과 이론의 적합성 유무는 별개이기는 하지만. 

저자와 아들의 공저인 <마이크로 코스모스>도 구입한 적이 있는데 보이지 않아 다시 구입했다. 아... 분명히 정리하지는 않았던 건데 모르겠다. 나중에 발견하면 누구한테라도 선물하지 뭐!   근데 문제는 받고 좋아할 사람이 없다는 것이긴 하다. 

독서잡기200927

<생명의 위대한 역사>와 <이일하 교수의 생물학 산책>을 읽고 있다. 두 권 다 교양 수준에 가까운 것들이고,    <생명의 위대한 역사>는  개체적 차원에서 생명의 이야기를 담고 있는 것이라 다큐멘터리를 보는 것처럼 조금 더 편하게 볼 수 있다.   물론 <생물학 산책>도 생명과학을 전공하고 있지 않은 이들을 대상으로 잡은 것이라 쉽게 풀어서 이야기 해준다는 느낌은 받지만 여전히 이해가 안되는 것도 사실이다. 

책을 읽으면서 다시 다 잡는 것들이 있다.  그 중 하나가 디옥시리보핵산은 디지털정보이지만, 단백질은 3차원 정보를 가졌다는 점이다.  그러니까 DNA는 서열로 정보가 정해지지만, 단백질은 3차원 구조를 잃어버리면 그 기능을 수행하지 못한다는 사실.  그 사실은 알고 있지만 그 사실이 어떠한 의미를 가지는 지는 이렇게 짚어주지 않으면 모르고 넘어갈때가 많다. 

 책의 1부 말미에는 세포 내의 소기관을 이야기하며 미트콘드리아에 대한 소기관을 설명하며 린 마굴리스의 세포공생설 이야기와 마지막에는 동료 교수의 연구결과도 한,두줄로 소개하는데("...동물성 와편모류들이 식세포 작용을 통해 식물성 미세조류들을 잡아먹으면서 일시적으로 광합성까지 하게 되는 것을 발견했고, 이 과정에서 대량의 유전자들이 도입되어 진화가 된다고 생각하고 있다.") 그것만 들어도 참 흥미롭다. 물론 그걸 이해 할 수 있는가 하는 문제는 두번째 문제다. 

린 마굴리스의 책은 사이언스 마스터즈 시리즈로 나온 <공생자 행성>과 도리언 세이건과 공저한 <생명이란 무엇인가?>가 있다. <마이크로코스모스>도 사둔 기억이 있는데 안 보인다. 바로는 아니더라도 곧 읽게 될 것 같다. 

독서잡기200916

  읽으면서 일반적으로 알려진 전염병들이 결코 박멸될 수 있는 성질의 것이 아님을 알게 되었다. 천연두나 소아마비등은 인수공통의 전염병이 아니기 때문에 퇴치운동의 결실을 맺을 수가 있었다.  그외 인수공통의 전염병의 경우 발명되지 않더라도 결코 박멸된 것은 아니다. 단지 어떤 생명체에 숨어 있을 뿐이다.  보유숙주, 증식숙주 등의 개념도 이 책을 통하여 알게 되었다.  보유숙주는  몸 속에 병원체를 보유하면서도 별다른 증상을 나타내지 않은 동물종을 말한다.  보유숙주라 대비되는 개념으로 종말숙주라는 것이 있다. '종간전파라는 도박에 모든 것을 걸고 인간의 몸속으로 뛰어든 바이러스 혈통이 그렇다는 것이다' 그 무시무시한 에볼라에게는 호모 사피엔스가 종말숙주가 될 것이다.

 아, 그리고 에볼라가 무시무시하기는 하지만 사람들을 녹아내리고 피를 토하게 하고... 뭐 그런 자극적인 모습으로 죽이지는 않는다. 며칠 전 페이퍼를 쓸때도 그런 이미지였지만, 그 페이퍼를 적어 놓고 다시 읽자마자 그 점에 대해 지적하는 구절이 나와서 재빨리 그 이미지를 수정하였다.  

증식숙주란 몸속에서 바이러스나 기타 병원체가 대량증식한 후 엄청난 양으로 외부에 방출되는 동물종을 말한다.  예를 들어 구제역의 전파에서 돼지가 하는 역할이다. 한 연구에 따르면 돼지가 숨을 내쉴 때는 구제역에 감염된 소나 양에 비해 30배나 많은 구제역 바이러스가 나온다고 한다.  그런데 제일 흥미로웠던 것은 헨드라 바이러스의 전파경로이다. 헨드라 바이러스가 처음 발견된 것은 1994년 9월 브리즈번 북쪽 변두리 지역의 말들이 쓰러지기 시작하면서 부터였다. 뒤이어 그 죽어가는 말들 옆에 있었던 이들도 비슷한 증상으로 죽어갔다. 나중에 전파를 시킨 보유숙주를 추적하니 박쥐였다.  그런데 이상하게도 야생동물을 돌보는 네트워크에서 128명의 박쥐 돌보미들이 항체검사에 들어 갔는데, 단 한명도 양성으로 밝혀지지 않았다. 그들은 장기간에 걸쳐 먹이를 주고, 마닞고, 드물지 않게 긁히거나 물리는 등의 밀접한 접촉을 했음에도.  쓰러지는 말들 옆에 있었던 이들이 전염되어 사망한 것을 생각하면 인간에게 전염이 안되는 것은 아닌데.  무언가 헨드라 바이러스를 증폭시키는 역할을 말들이 한 것인지 모르겠다. 

독서잡기200913

  현재 <인수공통 모든 전염병의 열쇠>를 읽고 있다. 집중하지 못하는 성격은 여전하다.  최근에 코로나-19 때문에 바이러스에 대한 관심이 많이 높아졌다. 예방의 차원에서야 권고되는 사항을 지키는 것은 당연하지만, 그 외에 것들도 궁금해진 것이다.  최근들어 관련 책들도 많이 나오는 것 같기도 하고.   이 책은 아마 2017년도에 초판이 나왔던 것 같다. 그러다가 올해 초에 2판이 나왔다. 

 우선 정말 재미있다.  저자는 과학연구에 최전선에 있는 연구자는 아니지만, 그렇기에 가독성 있고 재미있는 글을 써내려가는 것 같다.  물론 이런 기대는 날마다 충족되는 것은 아니다.  최근에 읽었던 대멸종 연대기는 너무 실망스러웠다. 

 내가 워낙에 늦게 읽는 편이기도 하지만, 피곤하고 바쁜 까닭에 이제야 2장의 중간을 읽고 있다.  2장의 주제는 그 무시무시한 에볼라 바이러스다.  원서가 2013년도에 나왔으니 지금은 어떤지 모르지만 에볼라 바이러스의 보유숙주를 아직도 모른다는 것이 놀라웠다. 에볼라 속에 다섯가지의 바이러스가 있는데 일단 치사율은 에볼라-자이르가 크다고 한다.  사실 생명의 가장 큰 목적은 생존과 번식인데, 이렇게 치사율이 높아서 그 목적을 달성할 수 있을까 싶은 생각이 들었지만, 이 책을 읽으니 그 의문이 다소 해결된 듯 하다. 그것은 우리 인간이 보유숙주가 아니며, 그들이 진화적 도약을 못했다는 것이다. 바이러스의 입장에서는 실패한 셈이다.  

어쨌든 그 발병의 묘사를 보면 너무 소름돋는다.  묶인 끈처럼 보이는 에볼라 바이러스의 모습을 보면 더더욱.

200830

 <새로운 생명의 역사>를 읽고 있었다.  닉 레인의 <생명의 도약>을 읽고 난 직후 바로 집어들었다. 내가 사둔, 내가 읽고자 하는 책 중에서는 가장 최근의(2015)의 책이다. 그런데 역시 이 책도 이해가 조금 힘들다. 제일 힘든 것은 (생)화학이다. 이 책에서도 내가 읽었던 닉 레인의 책에서도 언급한 것처럼 생명의 기원으로 열수분출공을 언급한다. 초창기 지구의 경우 우주에서 날라오는 각종 충격들로 부터 가장 안전했기 때문이다.  하지만 저자들은 이것보다는 화성에서 생명이 기원했음을 주장한다.  사실 이 주장에 대한 증거로 제시하는 것이 그럴싸한 것인지도 모르겠다. 다만 거부감이 일단 드는 것은 일부 망상가의 공상같은 느낌을 받았기 때문이다.  그래도 이해가 정확하지 않은 상태로는 또 납득할 것 같기도 한데 글쎄...

그리고 이런 생명의 기원을 다룬 장에서 넘어가  캄브리아기를 다룬 장으로 넘어 갔을때는 다소 흥미롭기는 했지만, 역시 이해가 어려운 건 마찬가지였다. 이때 절지동물이 다른 동물에 비해 많이 보인다는 것 말고는 기억이 나는게 별로 없다;;;이 중에서 스티븐 제이 굴드의 <원더풀 라이프>가 언급되어 얼른 읽고 싶다는 생각이 책무덤에 꺼내와 머리 맡에 다시 두었다. 

 그러다가, 다시 그 책은 덮어두고 <물질에서 생명으로>를 읽고 있다. 렉쳐 사이언스 시리즈로, 강의 내용을 묶은 책이다. 그러다 보니 쉽다.  재미있다.  아, 이수준이 내 수준이구나. 닉 레인의 책과 위의 책을 읽으면서 아리송했던데 순간 풀려버리는 부분이 있다.  난 항상 내 수준에서 아주 벅찬 책을 먼저 읽고 대중적인 수준의 책을 일게 된다. 

 여기 강의에서 이전에 읽었던, 읽고 있던 책의 이해를 도운 부분은 열수분출공과 관련돈 기원의 이야기 였다.  첫번째 강의 내용이었는데,  일반적으로 생명의 계통수로 보면 먼저 나뉘는 것이 세균과 고균이며, 이 둘의 합작으로 진핵생물이 등장하게 된다. 그렇다면, 세균과 고균이 공유하는 유전자를 분석하면 LUCA를 알 수 있지 않을까? 

그래서 보니 공통으로 보이는 유전자가 355개였으며,  산소가 없는 환경에서 살 수 있는 혐기성 생물이라는 결론이 나왔다. 

산소 호흡을 하는데 필요한 단백질이 하나도 없었던 것이다. 

그리고 수소를 이용했으며, 이산화탄소와 질소를 고정시키는 능력이 있었다.  이에 이산화탄소를 환원시켜 메탄을 만들고, 질소와 이산화탄소를 결합하여, 암모니아와 아미노산을 만들어낼 수 있었다.  닉 레인의 책에서 읽었던 뮐러의 그 실험 내용이 기억이 났다.  

루카는 수소와 이산화탄소, 질소가 있는 아주 뜨거운 곳에 있었으리라 추측하는데, 현재에 부합하는 곳이 열수분출공이다.  그리고 열수분출공의 구멍에는 열수가 분출되면서 황화철이라던가, 황화니켈같은 금속성분이 나오는데, 이 열수분출공에 있는 구멍에서 물질이 농축되어 반응이 일어나 그 결과물이 축적되고, 그 가운데 황화철과 황화니켈은 촉매반응 일으킨다고 한다.  그리고 열수는 그 자체로 알칼리성인데, 당시 원시 바다는 산성도가 높았다. 그래서 알칼리성 열수가 산성인 바닷물을 만난다면, 수소이온의 농도에 기울기가 생긴다.  이 농도의 기울기는 생체에너지를 생성한다. 그런데, 세포 수준에서는 미토콘드리아에서 전자를 전달하며 수소 이온 농도 차이를 만들고 그것이 에너지가 된다.  이것을 화학 삼투 이론인데, 이러한 조건이 자연적으로 만들어 질 수 있다는 것이다. 이 점에서 열수구가 생명체가 생겨나기 좋은 최적의 장소라 하는 것이다.  

지금 현재는 RNA를 다룬 세번째 장까지 읽었는데 이 챕터의 내용이 매우 흥미로웠다. 리보핵산의 기능으로 주로 강조되는 것이 DNA를 번역하여 단백질을 만들 수 있게 도와주는 것이다. 그런데 그런 RNA 중에서도 단백질을 만들지는 않는 것들이 있는데, 처음에는 쓰레기라 생각했으나, 시간이 지나 보니 이들도 특정한 역할이 있어 보였다. 쓰레기 RNA로 생각했던 것 하나가 유전자 발현을 조절하는 역할을 했던 것이다. 바로 마이크로RNA였다.  

mRNA에 붙어서 단백질이 합성되는 것을 억제한다던가, 바이러스의 RNA에 붙어 바이러스의 복제를 억제한다던가 하는.  이와 관련된 연구가 초파리를 대상으로 있었다고 하는데, 초파리에 마이크로 RNA 8번이 결손되면 크기가 작아지는 난쟁이 초파리가 된다고 한다.이는 포유류가 사람에게도 있는 것으로, 이 8번이 몸의 성장을 조절하는 역할을 한다는 것을 알았다.  그리고 마이크로 RNA 15, 16번은 세포를 필요할때 죽이는 역할을 한다고 한다.  뭔가 생각나는게 있는가. 맞다. 이들이 제대로 기능을 하지 않으면 암세포가 발생한다.  그리고 마이크로RNA17번과 20번은 세포분열에 역할이 있는 것들인데, 이 녀석들이 기능을 제대로 못하면 세포가 계속적으로 증식하는 결과가 생겨 암세포가 발생하기도 한다.   그리고 기타 촉매의 역할을 하기도 하지만, 가장 흥미로운 것은 이들 역시 유전물질로 기능하기도 한다는 점이다. 인플루엔자와 같은 바이러스에게 그렇다. 닉 레인이 아마 초기의 생명이 이런 식으로 기능했으리라 했던 것이 생각난다.  에이즈도 RNA로 만들어진 바이러스로, RNA에서 DNA로 전사되는 역전사가 일어난다.  그리고 RNA와 관련하여 실생활에서 활용할 수 있음을 예로 드는데 이 챕터내에서도 굉장히 흥미로운 부분이었다. 앞서 말한 것처럼 마이크로RNA가 암세포의 증식에 일부 기여하고 있음을 알 수 있는데,  그렇기에  암에 대한 진단도 가능하다는 것이다. 그 외에 약과 백신으로서도 역할을 기대할 수도 있다고 한다. 

 문들 교재로 쓰이는 캠벨의 생명과학 10판을 구입한 것을 기억하고 서가에서 꺼내왔다. 왜 충동구매 했는지는 기억 나지 않지만,  일주일에 1~2장을 읽는 식으로 해볼까 한다. 좀 무모한지 모르겠지만, 일단 시도를 해보고... 확실히 읽고나면 관련 책을 읽는데 이해의 정도가 다를것은 분명하다.  그런데 뒤지다 보니 발생생물학이란 것도 샀다.  왜? 기억에는 없다;;;  항상 느끼는 것지만 꼭 이런 종류의 종이를 써야 하나?...   좀 빳빳한 종이라도 쓰면 편하겠는데.  이런류의 책에서 쓰는 종이 때문에 항상 읽는게 불편하다.  

 일단, 올해 남은 기간 동안 반정도 진도가 나가는게 목표다.  물론 피곤하면 마음처럼 못할 수도 있지만...;;;;;