물질에서 생명으로 렉처 사이언스 KAOS 5
노정혜 외 지음 / 반니 / 2018년 1월
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 렉쳐 사이언스의 시리즈의 한권으로 생명의 기원 DNA, RNA ,단백질, 탄수화물, 유전자가위등의 내용을 다룬다. 강의를 묶은 만큼 많이 어렵지는 않다. RNA에 대한 내용이 개인적으로 많은 도움이 되었다. 센트럴 도그마라고 불리는 유전정보호의 전달과 발현, 표현을 말하는 개념을 뚜렷하게 그릴 수 있게 된 것이 소득이라면 소득이었다.  물론 이에 역하는 경우도 있다.(RNA를 기반으로 하는 바이러스의 경우 역으로 DNA를 만들기도 한다.)


 이제까지 관련도서를 읽으면서 헷갈린 것 중 하나가 ATP에 대한 것인데, 이 책으로 다소 이해가 깊어지게 되었다. 물론 디테일은 여전히 아리송하다.  그런데 읽으면서 내가 주변 인간과 사회뿐 아니라 자연과도 소통하고 있구나 싶었다. 9장은 유전자가위를 다루는 장인데, 개인적으로 강사의 이야기가 상당히 단정적이고, 그 주제도 논쟁적인 부분이라 약간은 찝찝한 느낌이 들었다.  그런데 과학자가 한반도 사람을 단일민족이라 칭하는 것도 처음 봤다. 


만족스러운 책이다. 


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 1.

 요즘에 <사이코지만 괜찮아>를 보고 새로 하는 <악의 꽃>도 재미있게 보고 있다. 어쩌다 보니 티브이앤 드라마를 계속 본다.  사이코지만 괜찮아라는 드라마에서는 오정세라는 배우가 눈에 많이 들어왔다.  뭐 현실에서는 보기 힘든 동화 같은 이야기들이지만.   대본집도 구입했다. 1권은 이미 구입했고, 2권은 아래께 구입을 했는데. 뭔 사고가 같있는지 어제까지 안왔다. 


 <악의 꽃>은 이준기, 문채원 주연의 드라마로, 처음부터 본것은 아니고 5회부터 봤다.  대충 내용은 살인마의 아들이자, 또 하나의 살인사건의 범인으로 지목된 남자가 형사와 결혼하여 살다가  자신의 아버지와 관련된 살인사건이 발생하고 그 사건을 조사하는 팀의 형사로서 수사를 진행하며 점점 남편을 의심하는 내용이다. 그 사이의 긴장감과  흔들리는 사랑과 같은 감정선이  주요 한 축이며, 또 하나는 도민석의 공범과,  도민수가 가짜신분으로 살고 있는 백희성, 그의 친아버지, 친어머니와 얽힌 미스터리가 하나의 축이 된다.  


개인적으로 문채원의 연기가 많이 아쉽다.  도민수의 아내인 차지원이라는 캐릭터가 가진 그 복잡한 감정선을 기대보다는 공감있게 살리지는 못한다는 생각이다. 그래도 다행히 이미 몰입한 상태라 너무 거슬리지는 않기는 하다만.


대본집은 안 나오나?... <사이코지만 괜찮아>는 1권은 금방 나오던데.


 2.

 몸하고 마음이 피곤하다 보니 보기 쉬운 드라마를 선호하게 된다. 좀 더 뭐 볼만한게 없는지 모르겠다. 




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 <새로운 생명의 역사>를 읽고 있었다.  닉 레인의 <생명의 도약>을 읽고 난 직후 바로 집어들었다. 내가 사둔, 내가 읽고자 하는 책 중에서는 가장 최근의(2015)의 책이다. 그런데 역시 이 책도 이해가 조금 힘들다. 제일 힘든 것은 (생)화학이다. 이 책에서도 내가 읽었던 닉 레인의 책에서도 언급한 것처럼 생명의 기원으로 열수분출공을 언급한다. 초창기 지구의 경우 우주에서 날라오는 각종 충격들로 부터 가장 안전했기 때문이다.  하지만 저자들은 이것보다는 화성에서 생명이 기원했음을 주장한다.  사실 이 주장에 대한 증거로 제시하는 것이 그럴싸한 것인지도 모르겠다. 다만 거부감이 일단 드는 것은 일부 망상가의 공상같은 느낌을 받았기 때문이다.  그래도 이해가 정확하지 않은 상태로는 또 납득할 것 같기도 한데 글쎄...


그리고 이런 생명의 기원을 다룬 장에서 넘어가  캄브리아기를 다룬 장으로 넘어 갔을때는 다소 흥미롭기는 했지만, 역시 이해가 어려운 건 마찬가지였다. 이때 절지동물이 다른 동물에 비해 많이 보인다는 것 말고는 기억이 나는게 별로 없다;;;이 중에서 스티븐 제이 굴드의 <원더풀 라이프>가 언급되어 얼른 읽고 싶다는 생각이 책무덤에 꺼내와 머리 맡에 다시 두었다. 
















 그러다가, 다시 그 책은 덮어두고 <물질에서 생명으로>를 읽고 있다. 렉쳐 사이언스 시리즈로, 강의 내용을 묶은 책이다. 그러다 보니 쉽다.  재미있다.  아, 이수준이 내 수준이구나. 닉 레인의 책과 위의 책을 읽으면서 아리송했던데 순간 풀려버리는 부분이 있다.  난 항상 내 수준에서 아주 벅찬 책을 먼저 읽고 대중적인 수준의 책을 일게 된다. 

 여기 강의에서 이전에 읽었던, 읽고 있던 책의 이해를 도운 부분은 열수분출공과 관련돈 기원의 이야기 였다.  첫번째 강의 내용이었는데,  일반적으로 생명의 계통수로 보면 먼저 나뉘는 것이 세균과 고균이며, 이 둘의 합작으로 진핵생물이 등장하게 된다. 그렇다면, 세균과 고균이 공유하는 유전자를 분석하면 LUCA를 알 수 있지 않을까? 

그래서 보니 공통으로 보이는 유전자가 355개였으며,  산소가 없는 환경에서 살 수 있는 혐기성 생물이라는 결론이 나왔다. 


산소 호흡을 하는데 필요한 단백질이 하나도 없었던 것이다. 


그리고 수소를 이용했으며, 이산화탄소와 질소를 고정시키는 능력이 있었다.  이에 이산화탄소를 환원시켜 메탄을 만들고, 질소와 이산화탄소를 결합하여, 암모니아와 아미노산을 만들어낼 수 있었다.  닉 레인의 책에서 읽었던 뮐러의 그 실험 내용이 기억이 났다.  


루카는 수소와 이산화탄소, 질소가 있는 아주 뜨거운 곳에 있었으리라 추측하는데, 현재에 부합하는 곳이 열수분출공이다.  그리고 열수분출공의 구멍에는 열수가 분출되면서 황화철이라던가, 황화니켈같은 금속성분이 나오는데, 이 열수분출공에 있는 구멍에서 물질이 농축되어 반응이 일어나 그 결과물이 축적되고, 그 가운데 황화철과 황화니켈은 촉매반응 일으킨다고 한다.  그리고 열수는 그 자체로 알칼리성인데, 당시 원시 바다는 산성도가 높았다. 그래서 알칼리성 열수가 산성인 바닷물을 만난다면, 수소이온의 농도에 기울기가 생긴다.  이 농도의 기울기는 생체에너지를 생성한다. 그런데, 세포 수준에서는 미토콘드리아에서 전자를 전달하며 수소 이온 농도 차이를 만들고 그것이 에너지가 된다.  이것을 화학 삼투 이론인데, 이러한 조건이 자연적으로 만들어 질 수 있다는 것이다. 이 점에서 열수구가 생명체가 생겨나기 좋은 최적의 장소라 하는 것이다.  


지금 현재는 RNA를 다룬 세번째 장까지 읽었는데 이 챕터의 내용이 매우 흥미로웠다. 리보핵산의 기능으로 주로 강조되는 것이 DNA를 번역하여 단백질을 만들 수 있게 도와주는 것이다. 그런데 그런 RNA 중에서도 단백질을 만들지는 않는 것들이 있는데, 처음에는 쓰레기라 생각했으나, 시간이 지나 보니 이들도 특정한 역할이 있어 보였다. 쓰레기 RNA로 생각했던 것 하나가 유전자 발현을 조절하는 역할을 했던 것이다. 바로 마이크로RNA였다.  


mRNA에 붙어서 단백질이 합성되는 것을 억제한다던가, 바이러스의 RNA에 붙어 바이러스의 복제를 억제한다던가 하는.  이와 관련된 연구가 초파리를 대상으로 있었다고 하는데, 초파리에 마이크로 RNA 8번이 결손되면 크기가 작아지는 난쟁이 초파리가 된다고 한다.이는 포유류가 사람에게도 있는 것으로, 이 8번이 몸의 성장을 조절하는 역할을 한다는 것을 알았다.  그리고 마이크로 RNA 15, 16번은 세포를 필요할때 죽이는 역할을 한다고 한다.  뭔가 생각나는게 있는가. 맞다. 이들이 제대로 기능을 하지 않으면 암세포가 발생한다.  그리고 마이크로RNA17번과 20번은 세포분열에 역할이 있는 것들인데, 이 녀석들이 기능을 제대로 못하면 세포가 계속적으로 증식하는 결과가 생겨 암세포가 발생하기도 한다.   그리고 기타 촉매의 역할을 하기도 하지만, 가장 흥미로운 것은 이들 역시 유전물질로 기능하기도 한다는 점이다. 인플루엔자와 같은 바이러스에게 그렇다. 닉 레인이 아마 초기의 생명이 이런 식으로 기능했으리라 했던 것이 생각난다.  에이즈도 RNA로 만들어진 바이러스로, RNA에서 DNA로 전사되는 역전사가 일어난다.  그리고 RNA와 관련하여 실생활에서 활용할 수 있음을 예로 드는데 이 챕터내에서도 굉장히 흥미로운 부분이었다. 앞서 말한 것처럼 마이크로RNA가 암세포의 증식에 일부 기여하고 있음을 알 수 있는데,  그렇기에  암에 대한 진단도 가능하다는 것이다. 그 외에 약과 백신으로서도 역할을 기대할 수도 있다고 한다. 
















 문들 교재로 쓰이는 캠벨의 생명과학 10판을 구입한 것을 기억하고 서가에서 꺼내왔다. 왜 충동구매 했는지는 기억 나지 않지만,  일주일에 1~2장을 읽는 식으로 해볼까 한다. 좀 무모한지 모르겠지만, 일단 시도를 해보고... 확실히 읽고나면 관련 책을 읽는데 이해의 정도가 다를것은 분명하다.  그런데 뒤지다 보니 발생생물학이란 것도 샀다.  왜? 기억에는 없다;;;  항상 느끼는 것지만 꼭 이런 종류의 종이를 써야 하나?...   좀 빳빳한 종이라도 쓰면 편하겠는데.  이런류의 책에서 쓰는 종이 때문에 항상 읽는게 불편하다.  


 일단, 올해 남은 기간 동안 반정도 진도가 나가는게 목표다.  물론 피곤하면 마음처럼 못할 수도 있지만...;;;;;






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생명의 도약 - 진화의 10대 발명
닉 레인 지음, 김정은 옮김 / 글항아리 / 2011년 3월
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 <진화>가 지구와 우리 생명들에게 가져다 준 10가지 발명들을 선정하여 보여준다. 선정에서부터 매우 흥미로우나 정말 이해를 하기 위해는 어려움이 많다. 


제일 흥미로웠던 것은 광합성과 시각이다. 광합성이 우리 지구 생명을 지탱하는 역할을 너무 간과했다는 생각을 했다. 시각에서는 눈의 진화와 관련하여 그 진화하는 과정이 (지질학적 시간을 고려한다면)그렇게 길지 않을 수 있다는 점이 흥미로웠다. 여기서 다시 인용된 리처드 도킨스의 말처럼 50퍼센트의 눈은 49퍼센트의 눈보다 1퍼센트의 나은 것이라는 이야기에 더 확신을 준다.  '눈'의 진화가 1번 있었고 그것이 지금 현재 생명체들의 눈의 기원일 수도 있다는 점은 매우 흥미로웠다.  


그 외에도 흥미로웠지만, 대다수가 지금 바로 이해하기에는 힘들었고, 물론 위에 언급한 두 가지도 어려웠다.   읽는 본인이 나름 이해하기 쉬운 부분에서는 저자의 비유가 좋기는 했지만, 대부분 이해를 더 방해하는 측면도 있기는 하다.  조만간 다시 읽을 기회가 있을 것 같으니, 그때는 좀 더 심도있는 이해를 얻을 수 있으면 한다.


그리고, 이 책을 읽으면서 더 확실히 다가온 것은 (당연하게도)  진화는 결코 의심할 수 없다는 것이다.  


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초딩 2020-08-17 23:09   좋아요 0 | 댓글달기 | URL
앗 찜해둔 책인데 서평 써주셔서 감사합니다~

가넷 2020-08-17 23:11   좋아요 1 | URL
아마 초딩님에게는 재미있는 책이 되지 않을까 싶네요 저는 아직 어려워서요~

초딩 2020-08-17 23:14   좋아요 0 | URL
어떤 계기로 갑자기 과학 도서를 마구 읽고 있는데
머리가 혼미하면서 뭔가 어렴풋하기도하고 그렇네요 ㅎㅎ
이럴 땐 역시 레이먼드 카버의 흐릿함이 좋은 것 같습니다. :-) 좋은 밤 되세요~
 

  닉 레인의 <생명의 도약>을 읽고 있다.   이제 겨우 1장을 읽었지만,  역시 어렵다는 것은 느낀다.  책은 저자가 진화가 발명한 10가지 발명 목록을 선정하여 풀어내는 식의 구성을 가진다.  첫번째는 물론 생명의 기원이다.  이 챕터에서 우선 '원시수프'라는 개념을 보여준다.  수업시간에 잠시스쳐지나가듯 들은 기억이 난다.  그 당시에는 뭔지 알지 몰랐다.    최소 십년 전에 기사에서 관련 내용을 읽은 것도 같다. 유리 플라스크에서 행했던 실험 이야기도 기억 나니 아마 맞을 것 같다.


실험내용은 암모니아와 메탄, 수소에 전기 스파크를 주자 아미노산이 생겨 났으며, 그 아미노산은  생명체의 아미노산과 비슷한 것이었고, 실험결과가 알려지자 대서특필되기도 하였다. 하지만 곧 원시수프라는 개념은 인기가 시들해졌다고 한다. 왜?   오래된 암석에 대한 분석에서 메탄과, 암모니아, 수소가 풍부한 적이 없다는 사실에서 그랬다.  그러다가 다시 부각이 된 것은 혜성과 운석에 유기물질이 널려 있다는 사실에서 비롯되었다고 한다.  몇몇 혜성과 운석에는 흙먼지와 섞인 얼음과 유기물질로 구성되고, 기체에 전기를 방전시켜 만든 아미노산과 놀라울 정도로 비슷한 아미노산이 들어 있는 것으로 알려졌기 때문이었다.  범종설이 이런 사실에서 비롯되기도 한 것 같아 보인다.  하지는 저자는 원시수프라는 개념이 해롭다고 말한다.  원시수프에서 발생한 것이 복제물질인 DNA RNA가 아니였기 때문이다. 


그렇다면 생명의 기원은 어디서 왔을까. 저자는 열수분출공이라는 곳을 주목한다. 열수분출공이라는 곳은 생명의 기원으로 본 것이다. 여기서 사실 정신을 잃어버렸다. ㅋㅋㅋ 이점만 기억 하고 있다.  지구의 생명체 대부분은 물질대사의 화학반응이 동일하다. 크레브스 회로는 유기분자를 소비하여 이산화탄소, 수소, ATP를 만들어 내는데, 열수분출공에서 이러한 회로의 역도 가능하여 생명에 필요한 유기분자를 만들어 낼 수 있다고 한다.  여기서 언급되는 화학반응들이 사실 어떤 의미를 가지는 것인지 모르겠다. 

디테일은 전혀 알수 없이 넘겨짚는 것에만으로도 흥미롭기는 하지만, 그 생명의 신비를 볼 수 있는 지력의 딸림에 아쉬움을 떨쳐버릴 수 없다.


작년에 이사할 적에 닉 레인의 책 중 <바이털궤스천>을 처리하는 것은 현명했다.  보나마나 몇장 읽지 못했을 것이다. 


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