건전지를 사용할 때는 가급적 같은 회사, 같은 제품을 함께 쓰도록 권장하고 있다. 건전지는 제품별로 방전시기와 방전특성이 조금씩 다르다. 예를 들어 어떤 건전지는 초기에는 일정한 전압을 유지하다가 급격히 전압이 떨어지는 특성을 보이고, 어떤 건전지는 일정기간이 지나면 서서히 전압이 떨어진다.다른 종류의 전지를 함께 사용하면 전자기기가 일정한 전압을 얻는데 지장을 줄 수 있다.
건전지 하나가 먼저 방전되면 다른 건전지가 그만큼의 사용량을 충당해야 하기 때문에, 건전지가 과열돼 터지거나 전해액이 흘러나올 수 있다. 또 건전지 발열량이 높으면 내부의 전해질이 녹아 흘러서 하얗게 굳을 수도 있는데, 전해질은 중금속과 독성이 있는 화학성분을 포함하고 있어서 인체에 유해하고, 외부로 전해질이 흐르는 경우에는 화재 위험이 있다. 이 때문에 건전지는 반드시 같은 제품을 사용해야 하고, 가급적이면 새 건전지와 헌 건전지를 함께 사용하는 것도 피해야 한다.