* 小説
放課後 長編 講談社 1985/09 第31回江戸川乱歩賞受賞・デビュー作 
방과후
卒業－雪月花殺人ゲーム 長編 講談社 1986/05 
졸업
白馬山荘殺人事件 長編 光文社カッパ・ノベルス 1986/08
学生街の殺人 長編 講談社 1987/06
11文字の殺人 長編 光文社カッパ・ノベルス 1987/12 
11문자 살인사건
魔球 長編 講談社 1988/07
香子の夢－コンパニオン殺人事件 長編 祥伝社ノン・ノベル 1988/10
浪花少年探偵団 連作短編集 講談社 1988/12
十字屋敷のピエロ 長編 講談社ノベルス 1989/01
眠りの森 長編 講談社 1989/05
鳥人計画 長編 新潮社 1989/05
殺人現場は雲の上 連作短編集 実業之日本社ジョイ・ノベルス 1989/08
ブルータスの心臓 長編 光文社カッパ・ノベルス 1989/10 
브루투스의 심장
依頼人の娘 連作短編集 祥伝社ノン・ノベル 1990/05
宿命 長編 講談社ノベルス 1990/06 
숙명
犯人のいない殺人の夜 短編集 光文社 1990/07
仮面山荘殺人事件 長編 徳間書店トクマ・ノベルズ 1990/12
変身 長編 講談社 1991/01 
변신 
헤드 Heads
回廊亭の殺人 長編 光文社カッパ・ノベルス 1991/07
交通警察の夜 短編集 実業之日本社 1992/01
ある閉ざされた雪の山荘で 長編 講談社ノベルス 1992/03
美しき凶器 長編 光文社カッパ・ノベルス 1992/10
同級生 長編 祥伝社 1993/02
分身 長編 集英社 1993/09 
레몬
浪花少年探偵団２ 連作短編集 講談社 1993/12
怪しい人びと 短編集 光文社 1994/02
むかし僕が死んだ家 長編 双葉社 1994/05
虹を操る少年 長編 実業之日本社 1994/08
パラレルワールド・ラブストーリー 長編 中央公論社 1995/02
あの頃ぼくらはアホでした エッセイ集 集英社 1995/03
怪笑小説 短編集 集英社 1995/10 
괴소소설
天空の蜂 長編 講談社 1995/11
名探偵の掟 連作短編集 講談社 1996/02
どちらかが彼女を殺した 長編 講談社ノベルス 1996/06
毒笑小説 短編集 集英社 1996/07 
독소소설
悪意 長編 双葉社 1996/09 
악의
名探偵の呪縛 長編 講談社文庫 1996/10
探偵ガリレオ 連作短編集 文藝春秋 1998/05
秘密 長編 文藝春秋 1998/09 第52回日本推理作家協会賞受賞 
비밀
私が彼を殺した 長編 講談社ノベルス 1999/02
白夜行 長編 集英社 1999/08 
백야행
嘘をもうひとつだけ 連作短編集 講談社 2000/04
予知夢 連作短編集 文藝春秋 2000/06
片想い 長編 文藝春秋 2001/03 
짝사랑 
아내를 사랑한 여자
超・殺人事件――推理作家の苦悩 短編集 新潮社 2001/06
サンタのおばさん 絵本 文藝春秋 2001/11
レイクサイド 長編 実業之日本社 2002/03 
호숫가 살인사건
トキオ 長編 講談社 2002/07
ゲームの名は誘拐 長編 光文社 2002/11 
게임의 이름은 유괴
手紙 長編 毎日新聞社 2003/03 
편지
おれは非常勤 集英社文庫 2003/05
殺人の門（角川書店, 2003）
幻夜（集英社, 2004）
환야
さまよう刃（朝日新聞社, 2004）
黒笑小説（集英社, 2005） 
흑소소설
容疑者Ｘの献身（文藝春秋,2005）2005年度直木賞受賞作品 
용의자 X의 헌신
探偵倶楽部（角川文庫, 2005）（「依頼人の娘」から加筆、修正して出版）
赤い指（講談社,2006） 
붉은 손가락
使命と魂のリミット（新潮社, 2006）
夜明けの街で（2007年、角川書店）
ダイイング・アイ（2007年、光文社）
流星の絆（2008年、講談社）
聖女の救済（2008年、文藝春秋） 
성녀의 구제
ガリレオの苦悩（2008年、文藝春秋）
パラドックス13（2009年、毎日新聞社）
カッコウの卵は誰のもの（2010年1月刊行予定、光文社）
* 随筆
あの頃ぼくらはアホでした（集英社, 1995）
ちゃれんじ?（実業之日本社, 2004）
さいえんす?（角川文庫, 2005）
夢はトリノをかけめぐる（光文社, 2006）
たぶん最後の御挨拶（文藝春秋, 2007）
* 児童書
サンタのおばさん（絵本）（文藝春秋, 2001）絵は杉田比呂美