니시노소노 모에는 비행기 사고로 부모님을 잃었다. 당시 충격이 커서 그런지 모든 것을 잊고 지냈는데 연구소 VR을 통해 기억이 다시 살아났다. 그리고 사이카와 교수님께 사과 할 일이 생겼다. 추억은 좋은 일투성이고 기억은 싫은 일투성이라 말하는 모에에게 싫은 추억도 있고 즐거운 기억도 있는 법이라 말해준다.
밀실사건을 조사하기 위해 섬에 남은 두 사람은 연구소로 향한다. VR카트 상자를 체험하던 모에는 가상현실에서 죽은 시키 박사를 마주하게 되고 과거를 기억하게 된다. 혹시 가상현실이 진짜 현실과 같다면 밀실사건의 비밀이 풀리지 않을까? 수학이 재미있는 이유는 풀어내면 정답이 나온다는거지... 자~ 이제부터 하나씩 풀어가보자.