간단히 말하자면, 다윈은 지질학적 기록은 극도로 불완전한 것이라고 쓰고 있다. 다 찢어지고 몇 장밖에 남지 않았고, 그나마 남아 있는 페이지도 두세 줄밖에 읽을 수 없고, 각각의 행에도 한두 개 단어밖에 남지 않은 것처럼 말이다. 우리가 화석기록에서 완만한 진화적 변화를 실제로 볼 수 없는 까닭은 우리가 무수한 발걸음 중에서 고작 한 걸음만을 연구하고 있기 때문이다. 변화가 갑작스럽게 일어나는 것처럼 보이는 것은 그 중간 단계가 사라져 버렸기때문이라는 것이다. - P246
대부분의 화석 생물의 역사는 점진론으로는 도저히 설명할 수 없는다음의 두 가지 특성을 가진다.
1. 정지(stasis). 대부분의 생물 좋은 지구상에서 생존하는 기간 동안 특정한 방향성을 띤 변화를 나타내지 않는다. 그들은 화석 기록에 나타날 때나 사라질 때나 똑같은 모습으로 보인다. 대개 형태상의 변화는 제한되고, 더구나 방향성도 없다.
2. 갑작스러운 출현(sudden appearance). 어느 지역에서 특정 생물 종들은 그 선조가 조금씩 변형(transformation)되는 과정을 통해 서서히 등장하는 것이 아니라 한꺼번에 완전히 완성된(fully formed)‘ 상태로 출현한다.
진화는 두 가지 주요한 양식으로 전개된다. 첫째, 계통의 변형으로,
어떤 개체군 전체가 한 상태에서 다른 상태로 변화한다. 그러나 모든 진화적 변화가 이런 양식으로 일어난다면, 생명계는 오랫동안 유지될 수없을 것이다. 계통 발생에 의한 진화는 다양성을 증가시키는 것이 아니라, 하나의 종에서 다른 종으로의 변형을 낳을 뿐이기 때문이다. 멸종(다른 종으로 진화하지 않고 사멸하여 사라져 버리는 것)이 너무나 흔히 일어나서 다양성을 증대시키는 메커니즘을 가지지 않은 생물상은 이윽고 전멸할 것이다. 두 번째 양식은 종 분화로, 이 과정이 지구에 새로 생물을 보급한다.
종 분화란 살아남은 부모의 계통에서 새로운 종이 가지를 쳐 나오는 것을 말한다. - P248
진화가 주로 주변부의 격리 집단에서 발생하는 종 분화라는 형태로 일어난다면, 화석 기록에 포함되는 것은 어떠한 것일까? 학자들이 발견하는 화석은 보통 규모가 큰 중심부 개체군의 유물이기 때문에, 종은 거의 분포 지역 전체에 걸쳐 정적인 상태에 있을 것이다. 선조종이 살고 있는 모든 지역에서, 후손 종은 그들이 진화했던 주변 지역에서 이동한 결과로 갑작스럽게 나타날 것이다. 주변 지역에서 종 분화의 직접적인 증거를 찾아낼 수 있을지도 모르지만, 이런 행운을 얻기란 그야말로 하늘의 별따기이다. 이러한 사건이 이처럼 작은 개체군에서 급속히 진행되기 때문이다. 이러한 이유로 화석 기록은 진화 이론이 예언한 것을 충실히 나타내는 것이지, 과거에는 풍부했던 이야기가 형편없이 삭제된 초라한 잔재로 남은 것이 아니다.
엘드리지와 나는 이러한 체계를 ‘단속 평형(斷續平衡, punctuated equilibria)‘ 이라고 부르고 있다. 생물 계통은 각각의 역사의 대부분의 기간 동안 거의 변화하지 않지만, 이따금 급격하게 일어나는 종 분화라는 사건으로 그 평온함이 단속, 즉 깨지는 것이다. 그리고 진화는 이러한 단속의 배치와 차등적 생존이다. - P250
만일 우리가 대진화에서의 불연속적 이행에 대한 많은 사례를 인정해야 한다면, 다윈주의는 붕괴하고 종 안에서의 작은 적응적 변화를 설명하는 이론으로 축소되지 않을까? 다윈주의의 진수(眞髓)는 자연 선택이 진화적 변화의 주된 창조력이라는 한마디에 들어 있다. 자연 선택이부적자(不適)를 제거하는 소극적 역할을 한다는 사실을 부정하는 사람은 아무도 없다. 그러나 다윈 이론은 자연 선택이 적자(適)를 만들것을 요구하기도 한다. 생명체는 선택을 통해 유전적 변이성의 임의적인 스펙트럼 속에서 매 단계마다 생존에 유리한 부분을 보존한다. 그리고 자연 선택은 일련의 단계를 밟아 나가는 동안 여러 가지 적응 구조를 구축하면서 적자를 만들어 내야 한다. 선택은 어떤 다른 힘이 새로운 종을 갑작스럽게 만들어 낸 후에 부적자를 내팽개치는 것이 아니라, 창조의 과정 그 자체를 지배하는 것이 틀림없다. - P259
골드슈미트는 이러한 타이밍의 작은 변화의 원인 유전자를 규명하고, 최종적으로 나타나는 큰 차이가 성장 초기에 작동하는 하나 또는소수의 ‘속도 유전자 (rate gene)‘의 작용을 반영한다는 사실을 증명했다.
그는 1918년에 속도 유전자라는 개념을 정리하고 20년 후 다음과 같이쓰고 있다.
돌연변이 유전자는 발생을 구성하는 여러 과정의 속도를 변화시킴으로써 …… 그 효과를 일으킨다. 그 속도란 성장이나 분화 속도, 분화에 필요한 재료를 생산하는 속도, 일정한 발생 시기에 일정한 물리적 또는 화학적 상태를 이끌어 내는 반응 속도, 특정 시기마다 배아가 가지는 발생 능력에 차이를 가져오는 여러 과정의 속도 등이다. - P261
그러나 법칙의 균일성이, 특히 국지적인 규모로, 자연스럽게 일어나는 격변을 배제하는 것은 아니다. 이따금 돌발적이고 근원적인 일회성변화가 에피소드처럼 일어나는 데에도 어떤 불변의 법칙들이 작용하고 있을 것이다. - P276
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